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堿基順序比對工具 - Sequence Manipulation Suite
堿基順序比對工具(按堿基標顏色)可以將FASTA格式或者GDE格式的多條序列,逐個堿基進行比對,根據比對情況標記相應的顏色。與Blast不同,它不會考慮gap,它只是簡單按照堿基順序逐一進行比較。特定堿基位如果完全相同則標記為黑色,如果不完全相同則標記為灰色,如果完全不同則留為白色。您可以控制堿基相似率,大于這個相似率即可顯示為黑色背景。

輸入多條FASTA格式或GDE格式的序列,長度限定在200000個字符.
  • 每行顯示 個堿基.
  • 堿基相同率達到多少,可認為是序列一致:
  • *顏色標記方法 .
輸入一組相似氨基酸并用逗號隔開,它將被用于相似程度計算。如果您是要比對DNA序列,請留空。


輸入每條序列比對時的開始位置,并用逗號隔開,順序請保持與序列順序一致. 形式如: 0, 200, 0, -1. 如果沒有指定,則默認為從第一位置(0位)開始。

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